Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF4Q15306 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms