Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPRRQ15256 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRRQ15256 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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