Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GBX1Q14549 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GBX1Q14549 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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