Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms