Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FAM53BQ14153 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM53BQ14153 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms