Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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COL4A6Q14031 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COL4A6Q14031 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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