Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms