Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PLD1Q13393 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms