Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms