Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF2Q12933 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF2Q12933 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF2Q12933 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF2Q12933 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF2Q12933 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAF2Q12933 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF2Q12933 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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