Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC10A2Q12908 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms