Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TROQ12816 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TROQ12816 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TROQ12816 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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