Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TWF1Q12792 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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