Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms