Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GBE1Q04446 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms