Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBXN1Q04323 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms