Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms