Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IRF8Q02556 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms