Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DSC2Q02487 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms