Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms