Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFI35P80217 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFI35P80217 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFI35P80217 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms