Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BACE1P56817 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BACE1P56817 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BACE1P56817 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BACE1P56817 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BACE1P56817 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms