Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MTTPP55157 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTTPP55157 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms