Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AIF1P55008 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms