Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB3P54284 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms