Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
THOP1P52888 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
THOP1P52888 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms