Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA5P52803 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms