Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RAB5CP51148 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RAB5CP51148 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RAB5CP51148 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RAB5CP51148 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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RAB5CP51148 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RAB5CP51148 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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