Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAGEA3P43357 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAGEA3P43357 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms