Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGAEP38570 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms