Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms