Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GJC1P36383 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GJC1P36383 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms