Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXA6P31267 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA6P31267 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms