Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CMPK1P30085 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMPK1P30085 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms