Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms