Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms