Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRZ1P23471 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRZ1P23471 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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