Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NFKB1P19838 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NFKB1P19838 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKB1P19838 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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