Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACADSP16219 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACADSP16219 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms