Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGA4P13612 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms