Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms