Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI3P10071 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI3P10071 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI3P10071 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GLI3P10071 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GLI3P10071 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLI3P10071 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms