Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC192P0DO97 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC192P0DO97 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms