Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM228BP0C875 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms