Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPBP07199 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPBP07199 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBP07199 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBP07199 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPBP07199 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms