Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIOO75962 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIOO75962 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIOO75962 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIOO75962 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIOO75962 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms