Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SLC25A20O43772 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms