Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FANCAO15360 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FANCAO15360 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FANCAO15360 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FANCAO15360 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms