Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CROCC2H7BZ55 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCC2H7BZ55 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCC2H7BZ55 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCC2H7BZ55 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCC2H7BZ55 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CROCC2H7BZ55 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms