Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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